RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 CASP5P51878 434 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 CFHR3Q02985 330 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 MTAPQ13126 283 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 RABEP1Q15276 862 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 RANBP10Q6VN20 620 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-206ENST00000467748 MAP4K1Q92918 833 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 VPS16Q9H269 839 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-206ENST00000467748 COL15A1P39059 1388 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 VPS4AQ9UN37 437 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 MOSPD3O75425 235 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 NDST3O95803 873 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 CLCA4Q14CN2 919 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 APOL1O14791 398 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 AREL1O15033 823 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGGTB-206ENST00000467748 ACOX1Q15067 660 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RABGGTB-206ENST00000467748 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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