RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ICE2	Q659A1	982 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DGKH	Q86XP1	1220 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CNTROB	Q8N137	903 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SUCLG2	Q96I99	432 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	POLK	Q9UBT6	870 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	NARF	Q9UHQ1	456 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TLK1	Q9UKI8	766 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC151	A5D8V7	595 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZAR1L	A6NP61	321 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ISM1	B1AKI9	464 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SUV39H1	O43463	412 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	RHCE	P18577	417 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	EPHX2	P34913	555 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PTH2R	P49190	550 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	WNT3	P56703	355 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SP2	Q02086	613 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	RHD	Q02161	417 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TBCC	Q15814	346 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CNGA2	Q16280	664 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CST9	Q5W186	159 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DUSP26	Q9BV47	211 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DKK3	Q9UBP4	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	INSL6	Q9Y581	213 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MRC1	P22897	1456 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MGEA5	O60502	916 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ELFN1	P0C7U0	828 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	NR2F6	P10588	404 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MYF5	P13349	255 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PEX2	P28328	305 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	FMO1	Q01740	532 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	RFK	Q969G6	155 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	APIP	Q96GX9	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PBK	Q96KB5	322 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ALG8	Q9BVK2	526 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	EHD3	Q9NZN3	535 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	HACL1	Q9UJ83	578 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SNED1	Q8TER0	1413 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ORC4	O43929	436 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	LRPAP1	P30533	357 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CACNA2D1	P54289	1103 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SATB1	Q01826	763 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	KRT17	Q04695	432 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MYO1E	Q12965	1108 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SEMA5A	Q13591	1074 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	E2F2	Q14209	437 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PLA1A	Q53H76	456 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DLK2	Q6UY11	383 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DTX2	Q86UW9	622 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MICU3	Q86XE3	530 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	C8orf48	Q96LL4	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00473	A8K010	186 aa		6.53	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms