RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TMEM199Q8N511 208 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ACTL9Q8TC94 416 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ITGAVP06756 1048 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CPB1P15086 417 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 L1CAMP32004 1257 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 MAGEA11P43364 429 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 NME3Q13232 169 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 MREGQ8N565 214 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 C8orf48Q96LL4 319 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FMO2Q99518 471 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 COX16Q9P0S2 106 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FZD10Q9ULW2 581 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PLXNA3P51805 1871 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 IL4RP24394 825 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 FAF2Q96CS3 445 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PIGVQ9NUD9 493 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TBC1D4O60343 1298 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 PLTPP55058 493 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 DEFB103AP81534 67 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SMARCB1Q12824 385 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CALCOCO2Q13137 446 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 BEND5Q7L4P6 421 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ALLCQ8N6M5 410 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 CCDC89Q8N998 374 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 EDEM1Q92611 657 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SNF8Q96H20 258 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 SLC9A7Q96T83 725 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 WHRNQ9P202 907 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-202ENST00000453996 APOL1O14791 398 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 EFEMP2O95967 443 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 KRT14P02533 472 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ATF2P15336 505 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 AIF1P55008 147 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ARPP19P56211 112 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GPS2Q13227 327 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 GPR17Q13304 367 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 KRT222Q8N1A0 295 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 IGSF21Q96ID5 467 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MCF2LO15068 1137 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 F9P00740 461 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 TGM2P21980 687 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 USP41Q3LFD5 358 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PQLC3Q8N755 202 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ADAM32Q8TC27 787 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 P3H4Q92791 437 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ART4Q93070 314 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 LRRC45Q96CN5 670 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 DDIT4Q9NX09 232 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 MTMR11A4FU01 709 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 BAIAP3O94812 1187 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 KLRC2P26717 231 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ADCY8P40145 1251 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 DDR2Q16832 855 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 EFHC2Q5JST6 749 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 NUP93Q8N1F7 819 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTU2-202ENST00000453996 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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