RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 LAG3P18627 525 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 NR4A1P22736 598 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PROZP22891 400 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MCCP23508 829 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 LIMK1P53667 647 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TSSK4Q6SA08 328 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 STAMQ92783 540 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 GLG1Q92896 1179 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PGBD4Q96DM1 585 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 DYDC2Q96IM9 177 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf92Q96LL3 132 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 WDR92Q96MX6 357 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA33Q96N06 139 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 DNAI1Q9UI46 699 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MAST4O15021 2626 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G6O60733 806 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CXCL14O95715 111 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 GLULP15104 373 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 EDNRBP24530 442 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 STARD6P59095 220 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 LPIN1Q14693 890 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MYBPC3Q14896 1274 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 RABL3Q5HYI8 236 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SMC5Q8IY18 1101 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CHST14Q8NCH0 376 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CEP95Q96GE4 821 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 NELL2Q99435 816 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MNTQ99583 582 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SETD4Q9NVD3 440 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 M0QZ92 97 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PPFIA2O75334 1257 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MBD4O95243 580 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA1P02708 482 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TSPY3P0CV98 308 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TSPY8P0CW00 308 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PTGS2P35354 604 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PPM1AP35813 382 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 GATMP50440 423 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC96Q2M329 555 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 LETM2Q2VYF4 491 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TTC38Q5R3I4 469 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 STPG1Q5TH74 334 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CTR9Q6PD62 1173 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 GPR149Q86SP6 731 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 GPR150Q8NGU9 434 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF558Q96NG5 402 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MLST8Q9BVC4 326 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 STC2O76061 302 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 CD52P31358 61 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 MTX1Q13505 466 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRK-211ENST00000429595 GIT2Q14161 759 aa7.04□□□□□ -1.28
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