RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SCD5Q86SK9 330 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA20Q8TB22 786 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 NAGPAQ9UK23 515 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 HCN2Q9UL51 889 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SPTBN2O15020 2390 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 RALAP11233 206 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 NTSR1P30989 418 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 DPP6P42658 865 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PRCPP42785 496 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 RAD23BP54727 409 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF394Q53GI3 561 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 RAB41Q5JT25 222 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TTC30AQ86WT1 665 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 STC2O76061 302 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 HMGB4Q8WW32 186 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TSG101Q99816 390 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 GABRG3Q99928 467 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CD248Q9HCU0 757 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.06■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MDM4O15151 490 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM24O15164 1050 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 HOXB2P14652 356 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SLC8A3P57103 927 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 COG7P83436 770 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC63Q05C16 580 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CBWD6Q4V339 395 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 ARID3AQ99856 593 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO10Q9UK96 956 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.05■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQF6 199 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SMC2O95347 1197 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 GABRG2P18507 467 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PMLP29590 882 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 HOXD12P35452 270 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 DGKGP49619 791 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PIGZQ86VD9 579 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MIB1Q86YT6 1006 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 RLN3Q8WXF3 142 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TIGD1Q96MW7 591 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 DCLK3Q9C098 648 aa22.04■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PRRT4C9JH25 899 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 GFRA2O00451 464 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K13O43283 966 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK5O95279 499 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CISD3P0C7P0 127 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CHKAP35790 457 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CUL2Q13617 745 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SDE2Q6IQ49 451 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SYT12Q8IV01 421 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 CHPFQ8IZ52 775 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 PGBD3Q8N328 593 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TATDN2Q93075 761 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 AP5Z1O43299 807 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 KLKB1P03952 638 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 SHC2P98077 582 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 LMAN2Q12907 356 aa22.02■■□□□ 1.12
LIMS1-208ENST00000428064 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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