RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414154.6

SMIM19-201, Transcript of small integral membrane protein 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM19, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19-201ENST00000414154 HMBSP08397 361 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 VDRP11473 427 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TNFRSF4P43489 277 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 UBE2HP62256 183 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 EFEMP1Q12805 493 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PAK1Q13153 545 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 CRY1Q16526 586 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ACDQ96AP0 544 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 NT5C1BQ96P26 610 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.6■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 LAMA1P25391 3075 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BICDL2A1A5D9 508 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 GDF9O60383 454 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ZBED1O96006 694 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 CISD3P0C7P0 127 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 CCDC192P0DO97 292 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TYRP14679 529 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PSEN1P49768 467 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 DGKEP52429 567 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PLK5Q496M5 336 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 RASSF3Q86WH2 238 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BHMTQ93088 406 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PLK2Q9NYY3 685 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 DEC1Q9P2X7 70 aa20.59■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PRRT4C9JH25 899 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PIK3R2O00459 728 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 RALAP11233 206 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BCAT1P54687 386 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ANO7Q6IWH7 933 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 PMF1Q6P1K2 205 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 FRMD1Q8N878 549 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 ACOX2Q99424 681 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 BBS2Q9BXC9 721 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 MARK1Q9P0L2 795 aa20.58■□□□□ 0.89
SMIM19-201ENST00000414154 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 E7ENQ6 273 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 P4HA2O15460 535 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 CACNG3O60359 315 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 PAEPP09466 180 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 BCKDHBP21953 392 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 RGS7P49802 495 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 ZNF132P52740 706 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 APBA1Q02410 837 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 ADIGQ0VDE8 80 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 CSRP2Q16527 193 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 TERB1Q8NA31 727 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 EDEM1Q92611 657 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 FBXO10Q9UK96 956 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 SLC12A8A0AV02 714 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 LCP1P13796 627 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 WASP42768 502 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 CNGA2Q16280 664 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 GJB7Q6PEY0 223 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SMIM19-201ENST00000414154 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms