RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 FZD10Q9ULW2 581 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 M0QYT0 321 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 MYZAPP0CAP1 466 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP2F1P24903 491 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 GATMP50440 423 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPY1Q01534 308 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 COX16Q9P0S2 106 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF487B1APH4 448 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TGM2P21980 687 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SEPT8Q92599 483 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CENPHQ9H3R5 247 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBED1O96006 694 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 BCAR1P56945 870 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ROR1Q01973 937 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SCLYQ96I15 445 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LTFP02788 710 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 OR4Q2P0C623 313 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 DEUP1Q05D60 604 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NME3Q13232 169 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT71Q3SY84 523 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ABI1Q8IZP0 508 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CASD1Q96PB1 797 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CAPN9O14815 690 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NRLP54845 237 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PIGVQ9NUD9 493 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 H7C0C1 242 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP3K6O95382 1288 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP5OP48047 213 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAM32Q8TC27 787 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TADA2AO75478 443 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NCAM1P13591 858 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 GOT1P17174 413 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MORF4L2Q15014 288 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 APBB2Q92870 758 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 HCSTQ9UBK5 93 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 USP3Q9Y6I4 520 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 OAZ2O95190 189 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ACSL3O95573 720 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LMAN1P49257 510 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CCL23P55773 120 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 IRGQQ8WZA9 623 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 EDEM1Q92611 657 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 AMPD1P23109 780 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 KYNUQ16719 465 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 CPT1BQ92523 772 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms