RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPYL1Q9H0U9 437 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 COX16Q9P0S2 106 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0U1RQF3 1178 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 H7C0C1 242 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GABRDO14764 452 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RASGRF2O14827 1237 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MCF2LO15068 1137 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF623O75123 536 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TOMM70O94826 608 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC4O95801 387 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 APOC2P02655 101 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BRCC3P46736 316 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP5OP48047 213 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LHX1P48742 406 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SKOR1P84550 965 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PTK7Q13308 1070 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TFDP2Q14188 446 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TAZQ16635 292 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN26Q16670 478 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LONRF1Q17RB8 773 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF6Q58WW2 860 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC31Q6UY01 552 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF157Q96PX1 679 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SYT15Q9BQS2 421 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AP1G2O75843 785 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ENDOD1O94919 500 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM200BP0CF97 657 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 IL4RP24394 825 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 YY1P25490 414 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TKTL1P51854 596 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BCAR1P56945 870 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DSC3Q14574 896 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PDK2Q15119 407 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 UPP1Q16831 310 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM131BQ86XD5 332 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PGBD4Q96DM1 585 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PCED1BQ96HM7 432 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK16Q96T55 309 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TBCBQ99426 244 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CYLDQ9NQC7 956 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT82Q9NSB4 513 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 APOL1O14791 398 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CABYRO75952 493 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CKBP12277 381 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MDH1P40925 334 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MATKP42679 507 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEA4P43358 317 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPN9P43378 593 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL34P49207 117 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT1E1P49888 294 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB27AP51159 221 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP2R2AP63151 447 aa4.14□□□□□ -1.75
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