RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.62■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.62■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.62■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.62■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.62■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 MDM4O15151 490 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 PJA2O43164 708 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 MBTPS2O43462 519 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 RFFLQ8WZ73 363 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CAPN9O14815 690 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 OLFM2O95897 454 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC175P0C221 793 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 NOS2P35228 1153 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 FGF13Q92913 245 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TASP1Q9H6P5 420 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.61■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 PDGFRAP16234 1089 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TCEAL1Q15170 157 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 LEXMQ3ZCV2 418 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ADAM32Q8TC27 787 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 RNF139Q8WU17 664 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 NT5C3BQ969T7 300 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 HDCP19113 662 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TFF2Q03403 129 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 EFEMP1Q12805 493 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC14Q49A88 953 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 TAC4Q86UU9 113 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 BTBD6Q96KE9 485 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 NPY6RQ99463 290 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 SMOC2Q9H3U7 446 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa24.59■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 MTA2O94776 668 aa24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 GPD1P21695 349 aa24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 MYADMQ96S97 322 aa24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.58■■□□□ 1.53
PDSS1-201ENST00000376215 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SOBPA7XYQ1 873 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 IGLV3-25P01717 112 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP25P42331 645 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 RAB6CQ53S08 254 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TADA2BQ86TJ2 420 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 MIB1Q86YT6 1006 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TBCBQ99426 244 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 DPYSL4O14531 572 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PFKLP17858 780 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 SDC4P31431 198 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 PTPN9P43378 593 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 ZXDBP98169 803 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 KIF5AQ12840 1032 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS1-201ENST00000376215 BNIPLQ7Z465 357 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms