RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361084.9

RAB25-201, Transcript of RAB25, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB25, Length 1,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25-201ENST00000361084 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 Q6ZNB5 142 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 ZNF276Q8N554 614 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 HMGB4Q8WW32 186 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 RLN3Q8WXF3 142 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 GSDMAQ96QA5 445 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TSG101Q99816 390 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 BBS2Q9BXC9 721 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 STC2O76061 302 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 RALAP11233 206 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TYRP14679 529 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 WASP42768 502 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 RNF43Q68DV7 783 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 PIGZQ86VD9 579 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 MIB1Q86YT6 1006 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 FRMD1Q8N878 549 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 SPATA20Q8TB22 786 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 EDEM2Q9BV94 578 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RAB25-201ENST00000361084 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 PRRT4C9JH25 899 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 SMC2O95347 1197 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 KLKB1P03952 638 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 KCNA4P22459 653 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 RAB41Q5JT25 222 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 PGBD3Q8N328 593 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 SMARCE1Q969G3 411 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 P2RY11Q96G91 374 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 SPACA7Q96KW9 195 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.52□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 LNP1A1A4G5 178 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 PATE3B3GLJ2 98 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 MAP3K13O43283 966 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 CISD3P0C7P0 127 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 HOXB2P14652 356 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 GABRG2P18507 467 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 NTSR1P30989 418 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 NUCB2P80303 420 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 LRRC63Q05C16 580 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 EFEMP1Q12805 493 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 CUL2Q13617 745 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 BECN1Q14457 450 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 BHMTQ93088 406 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 SLC35C1Q96A29 364 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 TIGD1Q96MW7 591 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 ACOX2Q99424 681 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 PLK2Q9NYY3 685 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.51□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 A0A1W2PQF6 199 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 TULP2O00295 520 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 HMBSP08397 361 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 PTGER3P43115 390 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 DGKGP49619 791 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 TKTL1P51854 596 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 COG7P83436 770 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 PDE4CQ08493 712 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB25-201ENST00000361084 LRMPQ12912 555 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms