RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MTA2O94776 668 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 OAS1P00973 400 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 GJA1P17302 382 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 SDC4P31431 198 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 NOP2P46087 812 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 TEAD2Q15562 447 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf120Q5SQS8 335 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 SYPL2Q5VXT5 272 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 KLHDC10Q6PID8 442 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 RXFP2Q8WXD0 754 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 NACA2Q9H009 215 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 TRPC7Q9HCX4 862 aa29.03■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf78A6NCI8 922 aa29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 TXNDC8Q6A555 127 aa29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 MSANTD2Q6P1R3 559 aa29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 CDH22Q9UJ99 828 aa29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 COG5Q9UP83 839 aa29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 BRWD1Q9NSI6 2320 aa29.02■■■□□ 2.24
GIPC1-201ENST00000345425 MYO1FO00160 1098 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CCP110O43303 1012 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 HADHBP55084 474 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 GPR158Q5T848 1215 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TASP1Q9H6P5 420 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN9P43378 593 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A52Q3SY17 297 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TRNP1Q6NT89 227 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 MAB21L3Q8N8X9 362 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ITFG1Q8TB96 612 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP57Q96MR6 1250 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SMOC2Q9H3U7 446 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 IP6K2Q9UHH9 426 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 DNMT3LQ9UJW3 386 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NUDT5Q9UKK9 219 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 DUSP10Q9Y6W6 482 aa29.01■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0U1RQJ8 604 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 DPYSL4O14531 572 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 COCHO43405 550 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CEBPBP17676 345 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ATRIPQ8WXE1 791 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NT5C3BQ969T7 300 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NPY6RQ99463 290 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CNPY3Q9BT09 278 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 LZTFL1Q9NQ48 299 aa29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 HDCP19113 662 aa28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 PSMA2P25787 234 aa28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SULT1E1P49888 294 aa28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 EFEMP1Q12805 493 aa28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 SUSD6Q92537 303 aa28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM7Q9C029 511 aa28.99■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 OLFM2O95897 454 aa28.98■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TBX18O95935 607 aa28.98■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 GBP1P32455 592 aa28.98■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP25P42331 645 aa28.98■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINB11Q96P15 392 aa28.98■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 MARCH2Q9P0N8 246 aa28.98■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM10Q9UDY6 481 aa28.98■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.98■■■□□ 2.23
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GIPC1-201ENST00000345425 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.239e-9■□□□□ 9.6
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GIPC1-201ENST00000345425 M0QYT0 321 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 BUB1O43683 1085 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 AVPR1AP37288 418 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 ATP11AP98196 1134 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TAC4Q86UU9 113 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 CMTM8Q8IZV2 173 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 BTBD6Q96KE9 485 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 TBCBQ99426 244 aa28.97■■■□□ 2.23
GIPC1-201ENST00000345425 POMKQ9H5K3 350 aa28.97■■■□□ 2.23
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