RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 CCNG1P51959 295 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS15P98073 1019 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 BST1Q10588 318 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RCN2Q14257 317 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CHI3L2Q15782 390 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 C16orf46Q6P387 395 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF534Q76KX8 674 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CHSY1Q86X52 802 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TREML1Q86YW5 311 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 VPS52Q8N1B4 723 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF398Q8TD17 642 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NSL1Q96IY1 281 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TLE6Q9H808 572 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SAR1AQ9NR31 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PAK5Q9P286 719 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MCM3APO60318 1980 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 EVPLQ92817 2033 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 HMX2A2RU54 273 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MEI4A8MW99 385 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 H3BRJ5 948 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC22O60826 627 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TGFB3P10600 412 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CYP2F1P24903 491 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 HDAC4P56524 1084 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TFDP2Q14188 446 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC6Q16204 474 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ANO7Q6IWH7 933 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 UCMAQ8WVF2 138 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KIF12Q96FN5 646 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MMP19Q99542 508 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DPP3Q9NY33 737 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 GINS2Q9Y248 185 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 LINGO3P0C6S8 592 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PEX19P40855 299 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PHKA2P46019 1235 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 AQP5P55064 265 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KDSRQ06136 332 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 BLMHQ13867 455 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MUM1Q2TAK8 710 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TEX44Q53QW1 395 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 C7orf31Q8N865 590 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NLRP7Q8WX94 980 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 E2F7Q96AV8 911 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 EBF4Q9BQW3 602 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KLC2Q9H0B6 622 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.54□□□□□ -1.2
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