RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PLPP6Q8IY26 295 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 COLGALT2Q8IYK4 626 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MLKLQ8NB16 471 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 WDR48Q8TAF3 677 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DEPTORQ8TB45 409 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 URGCPQ8TCY9 931 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PLEKHO2Q8TD55 490 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TCP11Q8WWU5 503 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PIGKQ92643 395 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TIPINQ9BVW5 301 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GBP3Q9H0R5 595 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 HIPK3Q9H422 1215 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MED4Q9NPJ6 270 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DMAC2Q9NW81 257 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 A0A0B4J269 797 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 FAM25EA8MYX2 175 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SULT1B1O43704 296 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SERPINI2O75830 405 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 KLHL18O94889 574 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SPARCP09486 303 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TMEM11P17152 192 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SYN1P17600 705 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GAP43P17677 238 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CCNE1P24864 410 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EPHB4P54760 987 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 RBL2Q08999 1139 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TBCCQ15814 346 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 FBXO22Q8NEZ5 403 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CPB2Q96IY4 423 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CRB3Q9BUF7 120 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NDE1Q9NXR1 346 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 C2CD2Q9Y426 696 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 A8MVJ9 347 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DCDC2CA8MYV0 355 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ANGPT2O15123 496 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SGTAO43765 313 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN1O60635 241 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TOM1L1O75674 476 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PROZP22891 400 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ETFBP38117 255 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ACOT2P49753 483 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ATP11AP98196 1134 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DR1Q01658 176 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 CARTPTQ16568 116 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 P3H1Q32P28 736 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 IFI44LQ53G44 452 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 KRT39Q6A163 491 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TNS4Q8IZW8 715 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 GSTCDQ8NEC7 633 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 AGR3Q8TD06 166 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 F5P12259 2224 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 A0A0G2JPF8 293 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 E2F8A0AVK6 867 aa3.25□□□□□ -1.89
TRDN-201ENST00000334268 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms