RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 GJB6O95452 261 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 GPD1P21695 349 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 GBP1P32455 592 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ITFG1Q8TB96 612 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 GDE1Q9NZC3 331 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.1■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 C2orf78A6NCI8 922 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PJA2O43164 708 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CCP110O43303 1012 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 COCHO43405 550 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FYNP06241 537 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CKMP06732 381 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CEBPBP17676 345 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FLT3P36888 993 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 EFEMP1Q12805 493 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CDH22Q9UJ99 828 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.09■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MOSPD3O75425 235 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TBX18O95935 607 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PSMA2P25787 234 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SUSD6Q92537 303 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FGF13Q92913 245 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 CNPY3Q9BT09 278 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 TFR2Q9UP52 801 aa22.08■■□□□ 1.13
YBX1-201ENST00000321358 RCCD1A6NED2 376 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 F9P00740 461 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 SULT1E1P49888 294 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 COG7P83436 770 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 TCEAL1Q15170 157 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 MIB1Q86YT6 1006 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 SERPINB11Q96P15 392 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 POMKQ9H5K3 350 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 CDH7Q9ULB5 785 aa22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 M0QYT0 321 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 RNF8O76064 485 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 ARHGAP25P42331 645 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 PTPN9P43378 593 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 RNF38Q9H0F5 515 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 DDIT4Q9NX09 232 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 PATJQ8NI35 1801 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 DPYSL4O14531 572 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 MBTPS2O43462 519 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 MTA2O94776 668 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 ATP11AP98196 1134 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 NME3Q13232 169 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 ACAP1Q15027 740 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 CCDC14Q49A88 953 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 RNF34Q969K3 372 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 NPY6RQ99463 290 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 COX16Q9P0S2 106 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.06■■□□□ 1.12
YBX1-201ENST00000321358 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms