RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 GREM1O60565 184 aa9.51□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 SLC12A8A0AV02 714 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 SOBPA7XYQ1 873 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 DPYSL4O14531 572 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 TPM1P09493 284 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 MTF1Q14872 753 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 TTC8Q8TAM2 541 aa9.5□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF263O14978 683 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 HSF2BPO75031 334 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 RTN2O75298 545 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 GZMAP12544 262 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 ABCB4P21439 1286 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA1Q92805 767 aa9.49□□□□□ -0.89
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