RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SERPINB4P48594 390 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 AP2B1P63010 937 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CATSPER1Q8NEC5 780 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 E5RI56 91 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 RANBP1P43487 201 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 MTM1Q13496 603 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 RNF43Q68DV7 783 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 SEC14L1Q92503 715 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 KAT2BQ92831 832 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 HPDLQ96IR7 371 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 CNPY3Q9BT09 278 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 LZTS1Q9Y250 596 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 USP20Q9Y2K6 914 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRG-201ENST00000295874 TGFB3P10600 412 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 KITP10721 976 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 IL10P22301 178 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 CAPZA2P47755 286 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 CRYMQ14894 314 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 EFCAB12Q6NXP0 572 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ANKRD27Q96NW4 1050 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 YIPF3Q9GZM5 350 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL31Q9H511 634 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 COL20A1Q9P218 1284 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 STARD13Q9Y3M8 1113 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 MYH1P12882 1939 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM49D1C9J1S8 452 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 F8VP50 259 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 IMPDH2P12268 514 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 RGS7P49802 495 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 TCEAL1Q15170 157 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ANGPT1Q15389 498 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ICA1LQ8NDH6 482 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D23Q9NUY8 699 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 RRN3P2A6NIE6 340 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 GJB6O95452 261 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ITGB3P05106 788 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 GLRA2P23416 452 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 EPHX2P34913 555 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 DMC1Q14565 340 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 PDK2Q15119 407 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 EFHC2Q5JST6 749 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 METTL7BQ6UX53 244 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ALLCQ8N6M5 410 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 PKD2L2Q9NZM6 624 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 CYP2C9P11712 490 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 TAS2R40P59535 323 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 STX3Q13277 289 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 LBRQ14739 615 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 DNAL1Q4LDG9 190 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ASAP3Q8TDY4 903 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 CLEC4DQ8WXI8 215 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 FAM111AQ96PZ2 611 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 SELENONQ9NZV5 590 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 HEY2Q9UBP5 337 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 USP18Q9UMW8 372 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 SOX13Q9UN79 622 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 CFAP99D6REC4 459 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 PCSK1P29120 753 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 GRIK1P39086 918 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 UBE3AQ05086 875 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGEF7Q14155 803 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 KRT72Q14CN4 511 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 MAPRE2Q15555 327 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 SYCP2LQ5T4T6 812 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 UBA3Q8TBC4 463 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 SLCO2A1Q92959 643 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 E2F7Q96AV8 911 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 RMDN1Q96DB5 314 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 SIK2Q9H0K1 926 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-201ENST00000295874 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms