RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 RALAP11233 206 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TYRP14679 529 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 MXI1P50539 228 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF394Q53GI3 561 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 SDE2Q6IQ49 451 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 RLN3Q8WXF3 142 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 USP3Q9Y6I4 520 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CACNG3O60359 315 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 NTSR1P30989 418 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 PIGKQ92643 395 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA4DQ92854 862 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CISHQ9NSE2 258 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 C4orf47A7E2U8 309 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM24O15164 1050 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 COG7P83436 770 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 SCD5Q86SK9 330 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TSG101Q99816 390 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ACACBO00763 2458 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 LNP1A1A4G5 178 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 MDM4O15151 490 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 KCNK5O95279 499 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 HOXB2P14652 356 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 DPP6P42658 865 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SLC8A3P57103 927 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PNOCQ13519 176 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GSDMAQ96QA5 445 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 STC2O76061 302 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PRCPP42785 496 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 DGKGP49619 791 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 RAD23BP54727 409 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZNB5 142 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 MIB1Q86YT6 1006 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CHPFQ8IZ52 775 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 FRMD1Q8N878 549 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TATDN2Q93075 761 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 DCLK3Q9C098 648 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 HCN2Q9UL51 889 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SMC2O95347 1197 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CISD3P0C7P0 127 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GABRG2P18507 467 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 CHKAP35790 457 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 WASP42768 502 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 IRX4P78413 519 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SYT12Q8IV01 421 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQF6 199 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PATE3B3GLJ2 98 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PRRT4C9JH25 899 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 AP5Z1O43299 807 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PMLP29590 882 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 EFEMP1Q12805 493 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 LMAN2Q12907 356 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 RAB41Q5JT25 222 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PIGZQ86VD9 579 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO10Q9UK96 956 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 GFRA2O00451 464 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF217O75362 1048 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 KLKB1P03952 638 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-201ENST00000250495 PTGER3P43115 390 aa22.1■■□□□ 1.13
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