RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 IGFLR1Q9H665 355 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 CDH9Q9ULB4 789 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PLAAQ9Y263 795 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 HES2Q9Y543 173 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TRIP11Q15643 1979 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PTGESO14684 152 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 DDHD2O94830 711 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 KRT14P02533 472 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 KRT1P04264 644 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ATF2P15336 505 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TSHRP16473 764 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 KLRC2P26717 231 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PCSK1P29120 753 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ATP5DP30049 168 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 MIPP30301 263 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ARSEP51690 589 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PDE4CQ08493 712 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 XRCC4Q13426 336 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 KCNC3Q14003 757 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 MORF4L2Q15014 288 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 RASA2Q15283 850 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TRADDQ15628 312 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC14Q49A88 953 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 C2CD6Q53TS8 623 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PMF1Q6P1K2 205 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TTC30AQ86WT1 665 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 METTL23Q86XA0 190 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ALLCQ8N6M5 410 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 HAUS1Q96CS2 278 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 MSLNLQ96KJ4 702 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TTC25Q96NG3 672 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ACBD6Q9BR61 282 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 DPH5Q9H2P9 285 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ST7Q9NRC1 585 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 CHST7Q9NS84 486 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF148Q9UQR1 794 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 LRRD1A4D1F6 860 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 E5RJQ4 531 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 FGF18O76093 207 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 F9P00740 461 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TGM2P21980 687 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 NOS2P35228 1153 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 KCNJ1P48048 391 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ADAM15Q13444 863 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 UPP1Q16831 310 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 DENND2CQ68D51 928 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 C12orf29Q8N999 325 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 IRGQQ8WZA9 623 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 RAPGEF5Q92565 580 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 NT5C3BQ969T7 300 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 CENPTQ96BT3 561 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 SENP8Q96LD8 212 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 SERPINB12Q96P63 405 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 HINFPQ9BQA5 517 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF670Q9BS34 389 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms