RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 RLFQ13129 1914 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RBL1P28749 1068 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ICAM3P32942 547 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 EBF3Q9H4W6 596 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.05■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ANKRD33BA6NCL7 494 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 GSTA3Q16772 222 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PAK5Q9P286 719 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 KLHL33A6NCF5 533 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGAP42A6NI28 874 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 B4GALT5O43286 388 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ENDOD1O94919 500 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PTPRAP18433 802 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 OSBPP22059 807 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 HSPA1LP34931 641 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RASIP1Q5U651 963 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 APOL6Q9BWW8 343 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 SIX4Q9UIU6 781 aa28.04■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 GJB1P08034 283 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 GSTT1P30711 240 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PDE1BQ01064 536 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM132AQ24JP5 1023 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PLD5Q8N7P1 536 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RNF217Q8TC41 542 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RXFP2Q8WXD0 754 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 USP6NLQ92738 828 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RNF157Q96PX1 679 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 CXCL8P10145 99 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 TFDP2Q14188 446 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 EEF1DP3Q658K8 133 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 BCO2Q9BYV7 579 aa28.03■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 HMX2A2RU54 273 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PDGFRAP16234 1089 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 KRT81Q14533 505 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ACAP1Q15027 740 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 DNAL1Q4LDG9 190 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 CFAP157Q5JU67 520 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 LGSNQ5TDP6 509 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PICK1Q9NRD5 415 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 GPD1P21695 349 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 GPD2P43304 727 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 RALGPS1Q5JS13 557 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 SCYL2Q6P3W7 929 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM42Q8IWZ5 723 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC33Q8N5R6 958 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 WRNIP1Q96S55 665 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF180Q9UJW8 692 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.01■■■□□ 2.08
FAM149A-201ENST00000227065 A0A088AWK7 358 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 B4GALT4O60513 344 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 HMGCRP04035 888 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 PRKCHP24723 683 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 C16orf46Q6P387 395 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 MPP5Q8N3R9 675 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 PRPSAP2O60256 369 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 CRABP2P29373 138 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 EPHB1P54762 984 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 IER5Q5VY09 327 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 UNC5AQ6ZN44 842 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 C1orf127Q8N9H9 656 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM176AQ96HP8 235 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 CNPY3Q9BT09 278 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 ETNK2Q9NVF9 386 aa28.01■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 ITM2AO43736 263 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 BPGMP07738 259 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 NFICP08651 508 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 ETS2P15036 469 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 IL4RP24394 825 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 CPOXP36551 454 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 GABRB2P47870 512 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 STX3Q13277 289 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 LPCAT4Q643R3 524 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 RNF111Q6ZNA4 994 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM50Q86XT4 487 aa28■■■□□ 2.07
FAM149A-201ENST00000227065 HIPK4Q8NE63 616 aa28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms