RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Birc5O70201 140 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SbdsP70122 250 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde1bQ01065 535 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk16Q04735 496 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plk1Q07832 603 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4952Q5FW57 296 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grb10Q60760 621 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Traf3Q60803 567 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Parp6Q6P6P7 630 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints6lQ8BND4 861 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnali1Q8BVN8 258 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gins2Q9D600 185 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MsraQ9D6Y7 233 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgk1Q9WVC6 431 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa13.13□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp8O09112 663 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc9Q3V038 219 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifnl2Q4VK74 193 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hbs1lQ69ZS7 682 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4921504E06RikQ8CET2 560 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan3Q9QY33 253 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AspgA0JNU3 564 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acp4D3YTS9 425 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lonrf1D3YY23 762 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2b23E9Q593 491 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf15O35622 218 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppef1O35655 650 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rdh7O88451 316 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pias1O88907 651 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CcnoP0C242 352 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc1a2P43006 572 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf512Q69Z99 562 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc19Q810M5 347 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brat1Q8C3R1 822 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam126bQ8C729 530 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekha4Q8VC98 588 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1c14Q91WT7 323 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slamf8Q9D3G2 278 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MipepA6H611 711 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap42B2RQE8 841 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Schip1P0DPB4 484 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasgrf1P27671 1262 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp13P33435 472 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TktP40142 623 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mxi1P50540 228 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd163Q2VLH6 1121 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sppl2bQ3TD49 578 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syce2Q505B8 171 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slitrk1Q810C1 696 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcn2Q8BP92 320 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a4Q8BUE1 797 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc66Q8K0B3 872 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ier5lQ99J55 406 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex19.1Q99MV2 351 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps22Q9CXW2 359 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam122aQ9DB52 284 aa13.12□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IqccA2ADZ8 418 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bfsp1A2AMT1 669 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apol11aE9PZG0 334 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a20bO88575 635 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcb1bP06795 1276 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk1P63239 753 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlg3P70175 849 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnc2Q14B80 642 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GsapQ3TCV3 858 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps51Q3UVL4 782 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan18Q80WR1 248 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dupd1Q8BK84 215 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Svs3bQ8BZH8 265 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NcaphQ8C156 731 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hectd2Q8CDU6 774 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rftn2Q8CHX7 500 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps37bQ8R0J7 285 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc7Q9WVM3 565 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lipo2D3YY49 398 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gml2G5E8L7 176 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3739L7N296 216 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigrO70570 771 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptk2P34152 1090 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SftpbP50405 377 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhx5P61375 402 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serping1P97290 504 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grb7Q03160 535 aa13.11□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3TQQ9 903 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.7 ms