RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 C2orf27AQ580R0 203 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TATDN2Q93075 761 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC35C1Q96A29 364 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 USP3Q9Y6I4 520 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1W2PQH9 124 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PMM2O15305 246 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TBX18O95935 607 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 RALAP11233 206 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PLA2G4AP47712 749 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 DGKEP52429 567 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CUL2Q13617 745 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 C11orf74Q86VG3 221 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 C12orf40Q86WS4 652 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ARID3AQ99856 593 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 NMUR1Q9HB89 426 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 OSER1Q9NX31 292 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 DEC1Q9P2X7 70 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 NAGPAQ9UK23 515 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 BICDL2A1A5D9 508 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ALDH1A2O94788 518 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 EPN2O95208 641 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CETN1Q12798 172 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ELF2Q15723 593 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ANO4Q32M45 955 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 EOGTQ5NDL2 527 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SCD5Q86SK9 330 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KBTBD6Q86V97 674 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM25Q86YD3 366 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 NETO1Q8TDF5 533 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 RTKNQ9BST9 563 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 GREM1O60565 184 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TULP3O75386 442 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 RHOBTB1O94844 696 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 FMO5P49326 533 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 COG7P83436 770 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KDSRQ06136 332 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CRY1Q16526 586 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PLK5Q496M5 336 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 SGO2Q562F6 1265 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB41Q5JT25 222 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ISM2Q6H9L7 571 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PIGZQ86VD9 579 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 RASSF3Q86WH2 238 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC33Q8N5R6 958 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 WBP2Q969T9 261 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 MARK1Q9P0L2 795 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 HESX1Q9UBX0 185 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 P4HA2O15460 535 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 VDRP11473 427 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TIE1P35590 1138 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 BCAT1P54687 386 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 MESP2Q0VG99 397 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 MORC3Q14149 939 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TTI2Q6NXR4 508 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 ALLCQ8N6M5 410 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 NAT16Q8N8M0 369 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TERB1Q8NA31 727 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRVP-204ENST00000639439 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms