RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	IL33	O95760	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CLTB	P09497	229 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	VAV1	P15498	845 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ACTR2	P61160	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PTGIS	Q16647	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751		A0A1W2PQC6	194 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	AP1G2	O75843	785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAGEA2	P43356	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC11A2	P49281	568 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SUOX	P51687	545 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	BCAT1	P54687	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GYS2	P54840	703 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PRKCE	Q02156	737 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TROAP	Q12815	778 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KRT81	Q14533	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RIT1	Q92963	219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MEIS1	O00470	390 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL18	O94889	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ADH1C	P00326	375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RPN2	P04844	631 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PRKCB	P05771	671 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ETV5	P41161	510 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CDK4	P11802	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF24	P17028	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM9	Q13443	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	P2RX5	Q93086	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RFK	Q969G6	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GML	Q99445	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MLX	Q9UH92	298 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751		M0QYT0	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	SHMT1	P34896	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CORO7	P57737	925 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	NFKBIE	O00221	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ACKR2	O00590	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	CD19	P15391	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	ABCB4	P21439	1286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-280	ENST00000636751	GPR153	Q6NV75	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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