RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 PTPRAP18433 802 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ATICP31939 592 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 CXCL9Q07325 125 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TRPC3Q13507 836 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TRNP1Q6NT89 227 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 RFX6Q8HWS3 928 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 VPS52Q8N1B4 723 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 CHST13Q8NET6 341 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PDP2Q9P2J9 529 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 I3L4J1 428 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ACKR2O00590 384 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 GCATO75600 419 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PIAS1O75925 651 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 BPGMP07738 259 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PGM1P36871 562 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SERPINB9P50453 376 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TAF5Q15542 800 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SEZ6Q53EL9 994 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 RABGAP1LQ5R372 815 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PQLC3Q8N755 202 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 UCMAQ8WVF2 138 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 STMN2Q93045 179 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TTC17Q96AE7 1141 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 E2F7Q96AV8 911 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PANX3Q96QZ0 392 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF670Q9BS34 389 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MIS12Q9H081 205 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 THAP1Q9NVV9 213 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SCOCQ9UIL1 159 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MAP3K13O43283 966 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 FKBP6O75344 327 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 KRT38O76015 456 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MICAL2O94851 1124 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PRKCBP05771 671 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MYL4P12829 197 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 AMPD1P23109 780 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 INHBEP58166 350 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 XIAPP98170 497 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 POU5F1BQ06416 359 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 FAM187BQ17R55 369 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF394Q53GI3 561 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 BOLA3Q53S33 107 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TTC39CQ8N584 583 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 EMC1Q8N766 993 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 NLRP4Q96MN2 994 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TSC22D3Q99576 134 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TSC2P49815 1807 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 EVPLQ92817 2033 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 MAP3K7O43318 606 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 CAPN15O75808 1086 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 TNNC2P02585 160 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 PDHA1P08559 390 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 VDRP11473 427 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 ANPEPP15144 967 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00598-211ENST00000636621 GPD1P21695 349 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms