RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GP5P40197 560 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MROH9Q5TGP6 573 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TRPV1Q8NER1 839 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ACOT9Q9Y305 439 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PALLDQ8WX93 1383 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PLA2R1Q13018 1463 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HAT1O14929 419 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SEC24BO95487 1268 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CDK8P49336 464 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 NUDT2P50583 147 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 C5orf22Q49AR2 442 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TTC26A0AVF1 554 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 AIM2O14862 343 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 WFS1O76024 890 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FAM200BP0CF97 657 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PDGFRAP16234 1089 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CHN2P52757 468 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SPATA18Q8TC71 538 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 UPB1Q9UBR1 384 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PSME2Q9UL46 239 aa6.55□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 UBDO15205 165 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CHST10O43529 356 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KPNA6O60684 536 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 STAG3L1P0CL83 205 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 QPRTQ15274 297 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GRTP1Q5TC63 336 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 OR8H2Q8N162 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TRPV3Q8NET8 790 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ANKS1AQ92625 1134 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CLPBQ9H078 707 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ATP10BO94823 1461 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DFFAO00273 331 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TSPAN19P0C672 248 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GCLMP48507 274 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ERAP2Q6P179 960 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SFRP1Q8N474 314 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FLCNQ8NFG4 579 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087X1B8 175 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CSH1P0DML2 217 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CSH2P0DML3 217 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FCER1AP12319 257 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 TNFRSF8P28908 595 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 POLD2P49005 469 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SKAP1Q86WV1 359 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DHFR2Q86XF0 187 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SPASTQ9UBP0 616 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2D6P10635 497 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 MACC1Q6ZN28 852 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 ADSSL1Q8N142 457 aa6.54□□□□□ -1.36
SCN2A-209ENST00000636071 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms