RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624927.3

LINC01128-215, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1128, human

TSL 5

Gene LINC01128, Length 677 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01128-215	ENST00000624927	RAB1A	P62820	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SP2	Q02086	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	GLG1	Q92896	1179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927		H3BML4	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ERC2	O15083	957 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	HTR1B	P28222	390 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC11A2	P49281	568 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PDE6C	P51160	858 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TPTE	P56180	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TISP43	B9A030	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MYO1F	O00160	1098 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PPP6C	O00743	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	UBXN7	O94888	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TJP3	O95049	919 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TUBB4A	P04350	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	EPHB2	P29323	1055 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	CYP4F2	P78329	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	KRT17	Q04695	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MCL1	Q07820	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927		Q6ZWC4	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	BRCA2	P51587	3418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927		A0A1W2PPL8	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ERBB2	P04626	1255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	PRKCB	P05771	671 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	CSF1R	P07333	972 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	CYP2D6	P10635	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MPG	P29372	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	DGKE	P52429	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	IGBP1	P78318	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	GPSM2	P81274	684 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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