RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 USP4Q13107 963 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PASD1Q8IV76 773 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SCML4Q8N228 414 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF214Q8ND24 703 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SH3RF2Q8TEC5 729 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 STK32AQ8WU08 396 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 IRF7Q92985 503 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SPAG5Q96R06 1193 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 LHX5Q9H2C1 402 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 NAGPAQ9UK23 515 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 E7ENQ6 273 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 LEFTY2O00292 366 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 KRT9P35527 623 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PBX1P40424 430 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 STAT1P42224 750 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 DAOAP59103 153 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PFKPQ01813 784 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PDCLQ13371 301 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 DSG2Q14126 1118 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 MTF1Q14872 753 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 YAF2Q8IY57 180 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SIX5Q8N196 739 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF276Q8N554 614 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TTC16Q8NEE8 873 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CLEC4CQ8WTT0 213 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 DNASE1L2Q92874 299 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ST7Q9NRC1 585 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CA14Q9ULX7 337 aa11.89□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 E5RJQ4 531 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 MDM4O15151 490 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 MMEP08473 750 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TNK2Q07912 1038 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TAF3Q5VWG9 929 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM110Q86TL2 294 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 BAP1Q92560 729 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CPXM1Q96SM3 734 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 NACA2Q9H009 215 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 MIS12Q9H081 205 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 GKN1Q9NS71 199 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNKQ9P0W0 207 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.88□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 SHISA7A6NL88 538 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR33A8MZF0 331 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 HRO43593 1189 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 RALAP11233 206 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ACADSBP45954 432 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PLCB2Q00722 1185 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF677Q86XU0 584 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 IRGQQ8WZA9 623 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 WBP2Q969T9 261 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 EBF3Q9H4W6 596 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 HPS4Q9NQG7 708 aa11.87□□□□□ -0.51
CCL3L3-201ENST00000612839 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms