RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 PRKD3O94806 890 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PYGMP11217 842 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 HLA-EP13747 358 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DRD1P21728 446 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 BCKDHBP21953 392 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SMARCA1P28370 1054 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DNM2P50570 870 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SCNN1BP51168 640 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SCNN1GP51170 649 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GFRA1P56159 465 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NLRP12P59046 1061 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GRIK3Q13003 919 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DRP2Q13474 957 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DMC1Q14565 340 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SEC23AQ15436 765 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PKDCCQ504Y2 493 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 FAM171A1Q5VUB5 890 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 EXOC4Q96A65 974 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NXPE2Q96DL1 559 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC140Q96MF4 163 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 MENTQ9BUN1 341 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 SPZ1Q9BXG8 430 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GP6Q9HCN6 339 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 DISC1Q9NRI5 854 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 NRBP2Q9NSY0 501 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 MIOSQ9NXC5 875 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 IPPQ9Y573 584 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.65□□□□□ -1.5
TRIM25-208ENST00000574234 CREBBPQ92793 2442 aa5.65□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CITO14578 2027 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ANP32CO43423 234 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ADAM11O75078 769 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CRTAMO95727 393 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SYPP08247 313 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ATF2P15336 505 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 MX2P20592 715 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ADSSP30520 456 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 HOXC12P31275 282 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 PTGER3P43115 390 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 AMPD2Q01433 879 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SETDB1Q15047 1291 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 INAVAQ3KP66 663 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 IQCEQ6IPM2 695 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SV2AQ7L0J3 742 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CEP57Q86XR8 500 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 HACE1Q8IYU2 909 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 TSTD1Q8NFU3 115 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 BRF1Q92994 677 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CHFRQ96EP1 664 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC51Q96ER9 411 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 MED8Q96G25 268 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 C1orf159Q96HA4 380 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 KRT23Q9C075 422 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.64□□□□□ -1.51
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