RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 NMUR1Q9HB89 426 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 NAGPAQ9UK23 515 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PATE3B3GLJ2 98 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LRMPQ12912 555 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF43Q68DV7 783 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT39Q6A163 491 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISM2Q6H9L7 571 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 FRMD1Q8N878 549 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 OTUB2Q96DC9 234 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOXL4Q96JB6 756 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ACOX2Q99424 681 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.56□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.55□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CETN3O15182 167 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ALDH1A2O94788 518 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAVIN2O95810 425 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXB2P14652 356 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TYRP14679 529 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD19P15391 556 aa7.55□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.55□□□□□ -1.2
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CCNDBP1-212ENST00000567690 EFEMP1Q12805 493 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFIL3Q16649 462 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBWD6Q4V339 395 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 EOGTQ5NDL2 527 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCD5Q86SK9 330 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASSF3Q86WH2 238 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB119Q8N690 84 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TERB1Q8NA31 727 aa7.55□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.55□□□□□ -1.2
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