RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCNDBP1-211ENST00000567434 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZNB5 142 aa17.93■□□□□ 0.46
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MARK1Q9P0L2 795 aa17.93■□□□□ 0.46
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