RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555470.1

PPP4R3A-209, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, human

TSL 3

Gene PPP4R3A, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TSPAN3	O60637	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RAMP2	O60895	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	BEST1	O76090	585 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ENDOD1	O94919	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GLP2R	O95838	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MT-ND3	P03897	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	QDPR	P09417	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	LAMP2	P13473	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PHKA1	P46020	1223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MCM2	P49736	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	NRG3	P56975	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	NLRP5	P59047	1200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PPARD	Q03181	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GALNT2	Q10471	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	BFSP1	Q12934	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RAB32	Q13637	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GPR68	Q15743	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KAZN	Q674X7	775 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MAML1	Q92585	1016 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470		H3BNC9	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	UBE2C	O00762	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SLC7A4	O43246	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	OPHN1	O60890	802 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GOSR1	O95249	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PGM3	O95394	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CLEC3B	P05452	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	P4HA1	P13674	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	IL1R1	P14778	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	EGR1	P18146	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KLRC1	P26715	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ACSL1	P33121	698 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TDO2	P48775	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SOX8	P57073	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RBP5	P82980	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TLE1	Q04724	770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SCAP	Q12770	1279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	STK4	Q13043	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MPP3	Q13368	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPP4R3A-209	ENST00000555470	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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