RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 RNF139Q8WU17 664 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MSANTD3Q96H12 275 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 NMUR1Q9HB89 426 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 GKN1Q9NS71 199 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CCL26Q9Y258 94 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 A0A1W2PQJ5 194 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 E2F8A0AVK6 867 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TMEM221A6NGB7 291 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 E7ENQ6 273 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 M0R296 226 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 LEFTY2O00292 366 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PIK3R2O00459 728 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 LTFP02788 710 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 GLI1P08151 1106 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MMEP08473 750 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 IFNAR2P48551 515 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 AMPD2Q01433 879 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ARID5AQ03989 594 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PRKCQQ04759 706 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 USP4Q13107 963 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 NR1H3Q13133 447 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PDCLQ13371 301 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ZNF77Q15935 545 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TAF3Q5VWG9 929 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 BEND5Q7L4P6 421 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PASD1Q8IV76 773 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TTC16Q8NEE8 873 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ATP2A3Q93084 1043 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 EXOC4Q96A65 974 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 OTUB2Q96DC9 234 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SYNCQ9H7C4 482 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 OSER1Q9NX31 292 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 AIPL1Q9NZN9 384 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.846e-6■□□□□ 9.1
CS-224ENST00000551155 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PRR33A8MZF0 331 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 E5RJQ4 531 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 STK25O00506 426 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MAN2B1O00754 1011 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CAPN9O14815 690 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TPM1P09493 284 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PBX1P40424 430 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PGFP49763 221 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 STARD6P59095 220 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 RUNX3Q13761 415 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TRIM14Q14142 442 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ERICH1Q86X53 443 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 SIX5Q8N196 739 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 BAP1Q92560 729 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 C18orf8Q96DM3 657 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ASIC4Q96FT7 647 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CPXM1Q96SM3 734 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 NELL2Q99435 816 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 DCLK3Q9C098 648 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-224ENST00000551155 CYTH4Q9UIA0 394 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms