RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 MATN2O00339 956 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ADCY3O60266 1144 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CRTAMO95727 393 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 APOC2P02655 101 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GABRB2P47870 512 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GALK1P51570 392 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 HK2P52789 917 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A3Q00325 362 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ADGRE1Q14246 886 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TAZQ16635 292 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZNX1 250 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ACTL9Q8TC94 416 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PAK5Q9P286 719 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CAPN8A6NHC0 703 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB39O15060 712 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 SLC16A4O15374 487 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 SIN3BO75182 1162 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 GLRA3O75311 464 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 BANF1O75531 89 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PROCP04070 461 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 SERPINB2P05120 415 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 SERPINE1P05121 402 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ZNF12P17014 697 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ALDH1B1P30837 517 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 DSG3P32926 999 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 STAT2P52630 851 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PEX3P56589 373 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PSMC5P62195 406 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ESRRGP62508 458 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 CLDN10P78369 228 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 NAB1Q13506 487 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 CUL2Q13617 745 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 DPYSQ14117 519 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 DPYSL3Q14195 570 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PSMD6Q15008 389 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PPM1NQ8N819 430 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 HM13Q8TCT9 377 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 STON2Q8WXE9 905 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 KLC2Q9H0B6 622 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 BCS1LQ9Y276 419 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 A0A0B4J269 797 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 MEI4A8MW99 385 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TISP43B9A030 160 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 STAM2O75886 525 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TMEM63AO94886 807 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ESRRBO95718 433 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 CAPNS1P04632 268 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 KITP10721 976 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 THRAP10827 490 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 PSMC3P17980 439 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ITGAXP20702 1163 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 OSBPP22059 807 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 MLH1P40692 756 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ROR1Q01973 937 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TUBB3Q13509 450 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 TFDP2Q14188 446 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 ACAP1Q15027 740 aa11.2□□□□□ -0.62
LMO3-215ENST00000537304 CRY2Q49AN0 593 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms