RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TMEM25Q86YD3 366 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TERB1Q8NA31 727 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 GON4LQ3T8J9 2241 aa25.36■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 HHLA1C9JL84 531 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ORC1Q13415 861 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 WBP2Q969T9 261 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 MARK1Q9P0L2 795 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 CEP192Q8TEP8 1941 aa25.35■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 C4orf47A7E2U8 309 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KCNA4P22459 653 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 DPP6P42658 865 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 SYKP43405 635 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ANO4Q32M45 955 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ZNF276Q8N554 614 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 NAT16Q8N8M0 369 aa25.34■■□□□ 1.65
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ACER3-211ENST00000531461 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 SPATA32Q96LK8 384 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TWNKQ96RR1 684 aa25.34■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 CACNG3O60359 315 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 NR2F2P24468 414 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 KRT85P78386 507 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TTC30AQ86WT1 665 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 RLN3Q8WXF3 142 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TMEM9BQ9NQ34 198 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 OSER1Q9NX31 292 aa25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
ACER3-211ENST00000531461 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CILPO75339 1184 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TBX18O95935 607 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 IRF1P10914 325 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ADORA2BP29275 332 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PSEN1P49768 467 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 DPYDQ12882 1025 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ST3GAL2Q16842 350 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.32■■□□□ 1.64
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ACER3-211ENST00000531461 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.32■■□□□ 1.64
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ACER3-211ENST00000531461 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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ACER3-211ENST00000531461 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 USP24Q9UPU5 2620 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PATE3B3GLJ2 98 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CYP26A1O43174 497 aa25.31■■□□□ 1.64
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ACER3-211ENST00000531461 NTSR1P30989 418 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 HOXD12P35452 270 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 GCLMP48507 274 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 NDUFA8P51970 172 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 KIF11P52732 1056 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 IRX4P78413 519 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PPP3CAQ08209 521 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 LMAN2Q12907 356 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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ACER3-211ENST00000531461 SYT12Q8IV01 421 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PIGKQ92643 395 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.31■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 MAP3K13O43283 966 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 KRT37O76014 449 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PRR29P0C7W0 189 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 KRT13P13646 458 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TYRP14679 529 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 GTF2H1P32780 548 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PLA2G4AP47712 749 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 BBS2Q9BXC9 721 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 NMUR1Q9HB89 426 aa25.3■■□□□ 1.64
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