RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPYSL4O14531 572 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENC1O14682 589 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCK2O43639 380 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 XYLBO75191 536 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFPL2O75678 378 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FYNP06241 537 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYL4P12829 197 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RARGP13631 454 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPN2P17706 415 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GBP1P32455 592 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAN1A1P33908 653 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPN9P43378 593 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGFP49763 221 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSEN1P49768 467 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEUP1Q05D60 604 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NME3Q13232 169 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRNP1Q6NT89 227 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAM32Q8TC27 787 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF34Q969K3 372 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMG2Q969U7 264 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBCBQ99426 244 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CORO1BQ9BR76 489 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NACA2Q9H009 215 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIDD1Q9HB75 910 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM92AA1XBS5 289 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPSAP2O60256 369 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGFBP4P22692 258 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GJC1P36383 396 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP3CCP48454 512 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EFEMP1Q12805 493 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRIN2CQ14957 1233 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACAP1Q15027 740 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ODF2Q5BJF6 829 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HECTD3Q5T447 861 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BEND5Q7L4P6 421 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF18AQ8NI77 898 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CASP10Q92851 521 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYRFLQ96LU7 910 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM161BQ96MY7 647 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCNAQ96QF7 691 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPY6RQ99463 290 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZWILCHQ9H900 591 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASAH2Q9NR71 780 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDIT4Q9NX09 232 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OSER1Q9NX31 292 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RRN3Q9NYV6 651 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms