RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 OSER1Q9NX31 292 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 LNP1A1A4G5 178 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 PATE3B3GLJ2 98 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 HHLA1C9JL84 531 aa17.86■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 GREM1O60565 184 aa17.86■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 DPYDQ12882 1025 aa17.86■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 C10orf76Q5T2E6 689 aa17.86■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 CYP3A43Q9HB55 503 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 NMUR1Q9HB89 426 aa17.86■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.85■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 FAM186BQ8IYM0 893 aa17.85■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.85■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 NUDT5Q9UKK9 219 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 HCN2Q9UL51 889 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 NUP205Q92621 2012 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 MYH10P35580 1976 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa17.84■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 CILPO75339 1184 aa17.84■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 ARMCX6Q7L4S7 300 aa17.84■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
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HERC3-211ENST00000513325 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa17.84■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
HERC3-211ENST00000513325 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa17.83■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 TYRP14679 529 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 WASP42768 502 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 PTGER3P43115 390 aa17.83■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC150Q8NCX0 1101 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
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HERC3-211ENST00000513325 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 TMEM9BQ9NQ34 198 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 DNMT3LQ9UJW3 386 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 NAGPAQ9UK23 515 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 STARD13Q9Y3M8 1113 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 ACACBO00763 2458 aa17.83■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQ27 194 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQ64 194 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQD8 194 aa17.82■□□□□ 0.44
HERC3-211ENST00000513325 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
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