RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPYSL4	O14531	572 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CKM	P06732	381 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SDHB	P21912	280 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	GDI1	P31150	447 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZXDB	P98169	803 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	IRF7	Q92985	503 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	BRD9	Q9H8M2	597 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	NMUR1	Q9HB89	426 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYLD	Q9NQC7	956 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF263	O14978	683 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYP26A1	O43174	497 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	GABBR2	O75899	941 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLCN1	P35523	988 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPD2	P43304	727 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSEN1	P49768	467 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TKTL1	P51854	596 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF77	Q15935	545 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PMF1	Q6P1K2	205 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCD5	Q86SK9	330 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCML4	Q8N228	414 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	STK33	Q9BYT3	514 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	OSER1	Q9NX31	292 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0QYV0	167 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	EPHB6	O15197	1021 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	COCH	O43405	550 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABL1	P00519	1130 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TGM1	P22735	817 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNA15	P30679	374 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLK7	P49862	253 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLCB2	Q00722	1185 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	LMNB2	Q03252	620 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBXN1	Q04323	297 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	USP4	Q13107	963 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTAP	Q13126	283 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYCP1	Q15431	976 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	STK32A	Q8WU08	396 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSFY1	Q96LI6	401 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	COL4A2	P08572	1712 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PQH9	124 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		F8VZ95	297 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MED7	O43513	233 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZBED1	O96006	694 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	USP8	P40818	1118 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARHGAP8	P85298	464 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTK2	Q05397	1052 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	YAF2	Q8IY57	180 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1B0GTH6	734 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	THAP12	O43422	761 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TLR5	O60602	858 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	TDGF1	P13385	188 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	JAM2	P57087	298 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	BPIFB4	P59827	614 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADIG	Q0VDE8	80 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTF1	Q14872	753 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHRD	Q9H2X0	955 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	USP18	Q9UMW8	372 aa		18.15	■□□□□ 0.5

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