RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511207.5

CCNH-209, Transcript of cyclin H, human

TSL 2

Gene CCNH, Length 451 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-209	ENST00000511207	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNH-209	ENST00000511207	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SEPT4	O43236	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	WDR47	O94967	919 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CER1	O95813	267 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CD4	P01730	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	JUP	P14923	745 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CAPN3	P20807	821 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ADORA2A	P29274	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	NTSR1	P30989	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	AKT1	P31749	480 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	LIFR	P42702	1097 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TUB	P50607	506 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	NXPH1	P58417	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ITIH3	Q06033	890 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CRHR2	Q13324	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	NFIX	Q14938	502 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	EXOC5	O00471	708 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	PROM1	O43490	865 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	CDKL5	O76039	1030 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ONECUT2	O95948	504 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ITGB3	P05106	788 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	LDHC	P07864	332 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ACRV1	P26436	265 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	GSTM5	P46439	218 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	NR1H2	P55055	460 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNH-209	ENST00000511207	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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