RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 STRADAQ7RTN6 431 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA18Q8TC71 538 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 P3H4Q92791 437 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAF2Q96CS3 445 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINB12Q96P63 405 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF670Q9BS34 389 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.55□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0U1RQF3 1178 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PQY0 241 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM23A6NLE4 172 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CABYRO75952 493 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD2P08910 425 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TGM2P21980 687 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA4P43358 317 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY1Q08828 1119 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ITGA7Q13683 1181 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CA9Q16790 459 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC9A4Q6AI14 798 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PLD5Q8N7P1 536 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PHF24Q9UPV7 400 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SQORQ9Y6N5 450 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SMAPO00193 183 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CLDN5O00501 218 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DAB1O75553 588 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 BEST1O76090 585 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MATKP42679 507 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MMP13P45452 471 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLCO1A2P46721 670 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ROR1Q01973 937 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ADIGQ0VDE8 80 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LONRF1Q17RB8 773 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NPNTQ6UXI9 565 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PQLC3Q8N755 202 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CPT1BQ92523 772 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf72Q96LT7 481 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TTC25Q96NG3 672 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SYT15Q9BQS2 421 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 EPN3Q9H201 632 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.54□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 APOL1O14791 398 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM200BP0CF97 657 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SKIP12755 728 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 L1CAMP32004 1257 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CDR1P51861 262 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 STAT4Q14765 748 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 BNIPLQ7Z465 357 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB106AQ8N104 65 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NT5C3BQ969T7 300 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PGBD4Q96DM1 585 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CDH9Q9ULB4 789 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ALOX15BO15296 676 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5DP30049 168 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms