RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 P4HA1P13674 534 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CTNNB1P35222 781 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT2P35908 639 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBP50607 506 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FANCCQ00597 558 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PLD1Q13393 1074 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SPIDRQ14159 915 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CNGA2Q16280 664 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZUG5 572 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP54Q7Z3B4 507 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NCOA7Q8NI08 942 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 OXER1Q8TDS5 423 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HES6Q96HZ4 224 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SDF4Q9BRK5 362 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 THAP9Q9H5L6 903 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1B0GWJ7 208 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRIQ4A6NIV6 560 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB5O15062 677 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRN2O75325 713 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CLN5O75503 358 aa4.76□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 ITGB8P26012 769 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTT1P30711 240 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LIFRP42702 1097 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GRB10Q13322 594 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TMC7Q7Z402 723 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 BNIPLQ7Z465 357 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HAUS1Q96CS2 278 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NOD2Q9HC29 1040 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MBD2Q9UBB5 411 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MED16Q9Y2X0 877 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5HO75947 161 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJB5O75953 348 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GJB5O95377 273 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V1G2O95670 118 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GNA14O95837 355 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 COL6A2P12110 1019 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SDSP20132 328 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK9P45984 424 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ADCY7P51828 1080 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-21P61565 698 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 COG7P83436 770 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP2R2BQ00005 443 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXK2Q01167 660 aa4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DRP2Q13474 957 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP8Q14790 479 aa4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAM209BQ5JX69 171 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 RANBP10Q6VN20 620 aa4.75□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC71Q8N4P6 559 aa4.75□□□□□ -1.65
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