RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SRL	Q86TD4	932 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ERICH1	Q86X53	443 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	C3orf20	Q8ND61	904 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ATL2	Q8NHH9	583 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	HERVK_113	Q902F9	699 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	HAUS1	Q96CS2	278 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAM2	Q99965	735 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM117A	Q9C073	453 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	EPN3	Q9H201	632 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PARVA	Q9NVD7	372 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	DPP3	Q9NY33	737 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SNTG2	Q9NY99	539 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	EURL	Q9NYK6	297 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	HES2	Q9Y543	173 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TLDC2	A0PJX2	215 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf60	A6NFR6	353 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ENDOD1	O94919	500 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	AMH	P03971	560 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	IVL	P07476	585 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ITIH2	P19823	946 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	KDELR1	P24390	212 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMA2	P25787	234 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGB7	P26010	798 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	MMP13	P45452	471 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	RGS7	P49802	495 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	RABGGTB	P53611	331 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB103A	P81534	67 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	INCA1	Q0VD86	236 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CNGA2	Q16280	664 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CA9	Q16790	459 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LONRF1	Q17RB8	773 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC38	Q5VT99	294 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DESI1	Q6ICB0	168 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NPNT	Q6UXI9	565 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF410	Q86VK4	478 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	NLRP14	Q86W24	1093 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM228A	Q86W67	206 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	OSTM1	Q86WC4	334 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC25	Q86WR0	208 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC30A	Q86WT1	665 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ALLC	Q8N6M5	410 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	C12orf29	Q8N999	325 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	APBB2	Q92870	758 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PGM2	Q96G03	612 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SNF8	Q96H20	258 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	HPDL	Q96IR7	371 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX27	Q96L92	541 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	PRO3102	Q9H379	93 aa		6.08	□□□□□ -1.44
C4BPB-208	ENST00000492730	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		6.08	□□□□□ -1.44

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