RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GPR20Q99678 358 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CBFA2T3O75081 653 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 NXPH3O95157 252 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PDHA1P08559 390 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CKMT1AP12532 417 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A3Q00325 362 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TLE2Q04725 743 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TBCCQ15814 346 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TTC22Q5TAA0 569 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RRAGAQ7L523 313 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 GPR149Q86SP6 731 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA1Q92805 767 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RILPL2Q969X0 211 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 KLC4Q9NSK0 619 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 A8MVJ9 347 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PPP6R2O75170 966 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 XBP1P17861 261 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA4P29622 427 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TP53BP2Q13625 1128 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PALM2Q8IXS6 379 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 HMGB4Q8WW32 186 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 HAS1Q92839 578 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 LENG9Q96B70 501 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF1Q9NS23 344 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EHD3Q9NZN3 535 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 E7EVH7 732 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PLSCR1O15162 318 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CER1O95813 267 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CNTFP26441 200 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 BLOC1S1P78537 153 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MTAPQ13126 283 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRRQ15256 657 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 NRN1LQ496H8 165 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TREML2Q5T2D2 321 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MAVSQ7Z434 540 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 HERVK_113Q902F9 699 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 NOD2Q9HC29 1040 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 J3KRW8 73 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 YY2O15391 372 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 LPXNO60711 386 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 POLBP06746 335 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ITGAMP11215 1152 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 DRD1P21728 446 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PBX1P40424 430 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 BMPR2Q13873 1038 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ASB12Q8WXK4 309 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 R3HDM4Q96D70 268 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EYA2O00167 538 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PEX1O43933 1283 aa8.72□□□□□ -1.01
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