RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 NMUR1Q9HB89 426 aa28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa28.17■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ADIGQ0VDE8 80 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 EFEMP1Q12805 493 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 MAMSTRQ6ZN01 415 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF276Q8N554 614 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 TFAP2BQ92481 460 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 KREMEN1Q96MU8 473 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF510Q9Y2H8 683 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 COL4A3Q01955 1670 aa28.16■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 THAP12O43422 761 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ADH5P11766 374 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 CCINQ13939 588 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ANO4Q32M45 955 aa28.15■■■□□ 2.1
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CCZ1B-211ENST00000486840 CHFRQ96EP1 664 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 PHOX2BQ99453 314 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 DCLK3Q9C098 648 aa28.15■■■□□ 2.1
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CCZ1B-211ENST00000486840 CNGB3Q9NQW8 809 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ST7Q9NRC1 585 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 OSER1Q9NX31 292 aa28.15■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 GFRA3O60609 400 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP17A1P05093 508 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 PON1P27169 355 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 GNA15P30679 374 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 PGFP49763 221 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 RGS7P49802 495 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 FSTL4Q6MZW2 842 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 HTR3DQ70Z44 454 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 SCD5Q86SK9 330 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 HSFY1Q96LI6 401 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 ZSCAN32Q9NX65 697 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 MARCH2Q9P0N8 246 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC8A2Q9UPR5 921 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 R4GN57 208 aa28.14■■■□□ 2.1
CCZ1B-211ENST00000486840 WDFY4Q6ZS81 3184 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 PROB1E7EW31 1015 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 TULP2O00295 520 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 PTK2Q05397 1052 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 PM20D1Q6GTS8 502 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 BBS7Q8IWZ6 715 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 PNKPQ96T60 521 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC13Q9NSE7 274 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 CNTN6Q9UQ52 1028 aa28.13■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 MDM4O15151 490 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO21O94952 628 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 EGFP01133 1207 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 APODP05090 189 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ACADSBP45954 432 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF132P52740 706 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 LY6G5CQ5SRR4 150 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 RHBDF2Q6PJF5 856 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 TSSK4Q6SA08 328 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 Q6ZS52 159 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 SPHK2Q9NRA0 654 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.12■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC12A8A0AV02 714 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 SART1O43290 800 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF40O75150 1001 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 HMBSP08397 361 aa28.11■■■□□ 2.09
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CCZ1B-211ENST00000486840 BPIFB4P59827 614 aa28.11■■■□□ 2.09
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CCZ1B-211ENST00000486840 GJB7Q6PEY0 223 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 IRGQQ8WZA9 623 aa28.11■■■□□ 2.09
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CCZ1B-211ENST00000486840 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR35Q9P2L0 1181 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP83Q9Y592 693 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 COL4A2P08572 1712 aa28.11■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX16P57768 344 aa28.1■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 SATB1Q01826 763 aa28.1■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.1■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 PMF1Q6P1K2 205 aa28.1■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 NOX5Q96PH1 765 aa28.1■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM62Q9BVG3 475 aa28.1■■■□□ 2.09
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF4Q9NR80 690 aa28.1■■■□□ 2.09
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