RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 DNAJC3Q13217 504 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TUSC3Q13454 348 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SERINC3Q13530 473 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GPR158Q5T848 1215 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 IQCEQ6IPM2 695 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CEP76Q8TAP6 659 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 USP33Q8TEY7 942 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 HMGB4Q8WW32 186 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 FGF11Q92914 225 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TMEM176AQ96HP8 235 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 KIRREL1Q96J84 757 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 MIPEPQ99797 713 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GAREM1Q9H706 876 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TBX20Q9UMR3 447 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CHMP2AO43633 222 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CILPO75339 1184 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 RECQL4O94761 1208 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SLITRK5O94991 958 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SYPP08247 313 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GABRR2P28476 465 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GNA15P30679 374 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 NTF4P34130 210 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ZNF76P36508 570 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GDNFP39905 211 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TLE1Q04724 770 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GRIK3Q13003 919 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 RTP5Q14D33 572 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ZNF124Q15973 351 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 MLANAQ16655 118 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 HLA-BQ31612 363 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CCDC178Q5BJE1 867 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GLRA4Q5JXX5 417 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 LETMD1Q6P1Q0 360 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 LRFN4Q6PJG9 635 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ATG14Q6ZNE5 492 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 RTL10Q7L3V2 364 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 HAUS6Q7Z4H7 955 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 C11orf74Q86VG3 221 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ZNF410Q86VK4 478 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ALLCQ8N6M5 410 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CNNM3Q8NE01 707 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CD101Q93033 1021 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 E2F7Q96AV8 911 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PLPPR2Q96GM1 343 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 HSPA12BQ96MM6 686 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ACAP3Q96P50 834 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 LGMNQ99538 433 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 KIF2CQ99661 725 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ANO3Q9BYT9 981 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 GPR88Q9GZN0 384 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SLC6A17Q9H1V8 727 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 ASAH2Q9NR71 780 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 U3KQE9 123 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 TMEM131Q92545 1883 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 PTPN13Q12923 2485 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.55□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 SPTA1P02549 2419 aa3.54□□□□□ -1.84
TNS1-215ENST00000480416 NID2Q14112 1375 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms