RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471724.5

SSR4-207, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-207ENST00000471724 NRDCO43847 1150 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 OLFM2O95897 454 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CKMP06732 381 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 FAM228BP0C875 321 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 WEE1P30291 646 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MTSS1LQ765P7 747 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 BEND5Q7L4P6 421 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 SCD5Q86SK9 330 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 XYLT1Q86Y38 959 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 RNF139Q8WU17 664 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MYADMQ96S97 322 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.72□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 C2orf78A6NCI8 922 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 DAB1O75553 588 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MYBL1P10243 752 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 LAMP2P13473 410 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 RARGP13631 454 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 SLC6A3Q01959 620 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 PTP4A2Q12974 167 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 TXNDC8Q6A555 127 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 C3orf20Q8ND61 904 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 CHP1Q99653 195 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 ISCUQ9H1K1 167 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 NMUR1Q9HB89 426 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-207ENST00000471724 VCANP13611 3396 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ANKRD62A6NC57 917 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 CAPN9O14815 690 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 COCHO43405 550 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ALADP13716 330 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 HDCP19113 662 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 SLC7A9P82251 487 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ARCQ7LC44 396 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 SMARCD2Q92925 531 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 E2F7Q96AV8 911 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ZNF653Q96CK0 615 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 ASB16Q96NS5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 OSER1Q9NX31 292 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 OBP2AQ9NY56 170 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 RRN3Q9NYV6 651 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 NENFQ9UMX5 172 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 SCINQ9Y6U3 715 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 A0A0C4DFX4 3053 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 NCAM1P13591 858 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 C2CD6Q53TS8 623 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-207ENST00000471724 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms