RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471538.1

SPEN-204, Transcript of spen family transcriptional repressor, humanhuman

TSL 2

Gene SPEN, Length 1,404 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEN-204ENST00000471538 HCRTO43612 131 aa6.69□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 TMEM63AO94886 807 aa6.69□□□□□ -1.34
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SPEN-204ENST00000471538 AKAP5P24588 427 aa6.69□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 HOXD10P28358 340 aa6.69□□□□□ -1.34
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SPEN-204ENST00000471538 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.69□□□□□ -1.34
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SPEN-204ENST00000471538 ITIH4Q14624 930 aa6.68□□□□□ -1.34
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SPEN-204ENST00000471538 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 BNIPLQ7Z465 357 aa6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 TRABD2AQ86V40 505 aa6.68□□□□□ -1.34
SPEN-204ENST00000471538 FAM228AQ86W67 206 aa6.68□□□□□ -1.34
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