RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MON1BQ7L1V2 547 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 XYLT1Q86Y38 959 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SCML4Q8N228 414 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SMARCD2Q92925 531 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC42Q96M95 316 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ASB16Q96NS5 453 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PANX2Q96RD6 677 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CAPN9O14815 690 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RTN2O75298 545 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 GJB6O95452 261 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CALB1P05937 261 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 GZMAP12544 262 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 NCAM1P13591 858 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 VIPR2P41587 438 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 TUBP50607 506 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CDK17Q00537 523 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 EFEMP1Q12805 493 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PTP4A2Q12974 167 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MIB1Q86YT6 1006 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RNF139Q8WU17 664 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 FGF14Q92915 247 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 KXD1Q9BQD3 176 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 TDP1Q9NUW8 608 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CCL26Q9Y258 94 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 CPQQ9Y646 472 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.25□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 VCANP13611 3396 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SOBPA7XYQ1 873 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 DPYSL4O14531 572 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 HSF2BPO75031 334 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 OLFM2O95897 454 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 FYNP06241 537 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ASGR2P07307 311 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 IRF1P10914 325 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PFKLP17858 780 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ABCB4P21439 1286 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 RRM1P23921 792 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 FCARP24071 287 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZXDBP98169 803 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 HTR4Q13639 388 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SLC18A3Q16572 532 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF6Q58WW2 860 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 MTSS1LQ765P7 747 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 DEFB106AQ8N104 65 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ADAM32Q8TC27 787 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF653Q96CK0 615 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms