RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462993.1

SNX10-208, Transcript of sorting nexin 10, human

TSL 1 (best)

Gene SNX10, Length 806 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX10-208	ENST00000462993	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX10-208	ENST00000462993		A0A087WWL8	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	POM121B	A6NF01	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	BBOX1	O75936	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	EPHX2	P34913	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	EPS15	P42566	896 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	STT3A	P46977	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	KCNJ4	P48050	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SLC11A2	P49281	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	UCP3	P55916	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	BTK	Q06187	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	GCKR	Q14397	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PNKP	Q96T60	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SCN4A	P35499	1836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993		A0A1B0GUL6	1792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	MYO1C	O00159	1063 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SNAP23	O00161	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PSMD14	O00487	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ECE2	O60344	883 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TAF5L	O75529	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	FGF18	O76093	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	KIF20A	O95235	890 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	GRP	P07492	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	C1S	P09871	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	FCER1A	P12319	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TSHR	P16473	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TNFSF4	P23510	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	INHBC	P55103	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	CXCL9	Q07325	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PIGF	Q07326	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	RAB32	Q13637	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	GPC2	Q8N158	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	EYA3	Q99504	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX10-208	ENST00000462993	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms