RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443037.1

SOX9-AS1-206, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOX9-AS1, Length 394 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIF11P52732 1056 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MAP3K7CLP57077 242 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GAD2Q05329 585 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DMWDQ09019 674 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 STIM1Q13586 685 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HTR3DQ70Z44 454 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C11orf74Q86VG3 221 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 USP33Q8TEY7 942 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RMDN1Q96DB5 314 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TWNKQ96RR1 684 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PNKPQ96T60 521 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 USP3Q9Y6I4 520 aa14.78□□□□□ -0.04
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 K7EQS6 105 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PSMA7O14818 248 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TLR5O60602 858 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 APBB3O95704 486 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GRIA2P42262 883 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CSRP2Q16527 193 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SEMA4DQ92854 862 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CEP63Q96MT8 703 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GMIPQ9P107 970 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.77□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 AXIN1O15169 862 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 APODP05090 189 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ADH5P11766 374 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PLA2G4AP47712 749 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC8A3P57103 927 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DMC1Q14565 340 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PROX2Q3B8N5 592 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CEP68Q76N32 757 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TTC16Q8NEE8 873 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NACA2Q9H009 215 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CISHQ9NSE2 258 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.76□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 P4HA2O15460 535 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GREM1O60565 184 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KAT7O95251 611 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ADORA2BP29275 332 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DGKEP52429 567 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RAD23BP54727 409 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MMRN1Q13201 1228 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RAB41Q5JT25 222 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RASSF3Q86WH2 238 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC35C1Q96A29 364 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RTKNQ9BST9 563 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MARK1Q9P0L2 795 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.75□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BICDL2A1A5D9 508 aa14.74□□□□□ -0.05
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RALAP11233 206 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms