RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 KITP10721 976 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RBP3P10745 1247 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CPOXP36551 454 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KCNJ11Q14654 390 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D25Q3MII6 688 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 WDR78Q5VTH9 848 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RFX6Q8HWS3 928 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NME8Q8N427 588 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PPM1NQ8N819 430 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RILPQ96NA2 401 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF302Q9NR11 478 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 K7ERI5 159 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 AOC1P19801 751 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 OAZ1P54368 228 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ASPHQ12797 758 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LGSNQ5TDP6 509 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 WDTC1Q8N5D0 677 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP36Q96G28 342 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 C19orf81C9J6K1 198 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CREB3O43889 395 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CD48P09326 243 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 WASHC5Q12768 1159 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CBLBQ13191 982 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MED21Q13503 144 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 STXBP2Q15833 593 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MIS12Q9H081 205 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 IRAK4Q9NWZ3 460 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CHADO15335 359 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RFPL1O75677 317 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRBP14927 111 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 XIAPP98170 497 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PDE1BQ01064 536 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GRM2Q14416 872 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KLRG1Q96E93 195 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO40Q9UH90 709 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MEI4A8MW99 385 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 OPHN1O60890 802 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NRLP54845 237 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SFT2D3Q587I9 215 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLFN12LQ6IEE8 588 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA18Q8TC71 538 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NAT14Q8WUY8 206 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGC3Q9UN70 934 aa15.49■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CYB561D2O14569 222 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 OATP04181 439 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KRT3P12035 628 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ROR1Q01973 937 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PYDC1Q8WXC3 89 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 C12orf42Q96LP6 360 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL4Q9C0H6 718 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0B4J269 797 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 BIRC5O15392 142 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 AVILO75366 819 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PIGRP01833 764 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 BPGMP07738 259 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ETS2P15036 469 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD6Q8NC69 237 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FAF2Q96CS3 445 aa15.48■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EBF4Q9BQW3 602 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms