RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 EMC10Q5UCC4 262 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SMOQ99835 787 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ROR1Q01973 937 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MORF4L2Q15014 288 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 LHX8Q68G74 356 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PGBD4Q96DM1 585 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 H7C0C1 242 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 APOL1O14791 398 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FAM163BP0C2L3 166 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 L1CAMP32004 1257 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEA4P43358 317 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5OP48047 213 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R2AP63151 447 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MTM1Q13496 603 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ARCQ7LC44 396 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC33Q8N5R6 958 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PGM2Q96G03 612 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PQY0 241 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 NRP1O14786 923 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 BANF1O75531 89 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 BCAR1P56945 870 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 GRIK3Q13003 919 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ODC1P11926 461 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2F1P24903 491 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MDH1P40925 334 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC38Q502W7 563 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD13Q8WZ19 329 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CPT1BQ92523 772 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CDH9Q9ULB4 789 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TUSC3Q13454 348 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF670Q9BS34 389 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-209ENST00000428120 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 DAB1O75553 588 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NME3Q13232 169 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 DPYSL2Q16555 572 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 MYLPFQ96A32 169 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 E7ENQ6 273 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 B4GALT3O60512 393 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 LSP1P33241 339 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 STRADAQ7RTN6 431 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 MDM1Q8TC05 714 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM32Q8TC27 787 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM209Q96SK2 561 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 USP17L7P0C7H9 530 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PCSK1P29120 753 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 BASP1P80723 227 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FOXO6A8MYZ6 492 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 M0QYT0 321 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 HTRA3P83110 453 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 GBE1Q04446 702 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms